انواع HPV که تمایل به ایجاد زگیل دارند و به ندرت باعث سرطان می شوند، انواع کم خطر نامیده می شوند. عفونت HPV تناسلی کم خطر می تواند موجب به وجود آمدن زگیل های گل کلمی شکل در ناحیه تناسلی و مقعد یا اطراف آن ها شود. در زنان، زگیلها ممکن است در مناطقی ظاهر شوند که همیشه مورد توجه قرار نمیگیرند، مانند دهانه رحم و واژن.